Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC103Q8IW40 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms