Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL3Q8IVW4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms