Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC50Q8IVM0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms