Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR5

TMTC1, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC1Q8IUR5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMTC1Q8IUR5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMTC1Q8IUR5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMTC1Q8IUR5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms