Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
VPS37DQ86XT2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS37DQ86XT2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS37DQ86XT2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms