Protein–RNA interactions for Protein: Q86U17

SERPINA11, Serpin A11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA11Q86U17 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA11Q86U17 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms