Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF5Q86SE9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCGF5Q86SE9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 753.6 ms