Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT25Q7Z3Z0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT25Q7Z3Z0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms