Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP1Q7RTM1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP1Q7RTM1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms