Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8C5

SYT13, Synaptotagmin-13, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT13Q7L8C5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT13Q7L8C5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT13Q7L8C5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms