Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYS1Q717R9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms