Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
FGD6Q6ZV73 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
FGD6Q6ZV73 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
FGD6Q6ZV73 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms