Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM43BQ6ZT52 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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