Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf47Q6ZRZ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms