Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRM9

Putative uncharacterized protein FLJ46235, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZRM9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6ZRM9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q6ZRM9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms