Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLCO4C1Q6ZQN7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms