Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP1Q6WKZ4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP1Q6WKZ4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms