Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC4A10Q6U841 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A10Q6U841 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms