Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SAMD1Q6SPF0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms