Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM220Q6QAJ8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms