Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL35Q6PF15 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL35Q6PF15 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms