Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMBQ6PCB8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms