Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF549Q6P9A3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF549Q6P9A3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF549Q6P9A3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms