Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASC4Q6P4E1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms