Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1L6

ZNF343, Zinc finger protein 343, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF343Q6P1L6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF343Q6P1L6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF343Q6P1L6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms