Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PRPF40BQ6NWY9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms