Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI2

GPAT2, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT2Q6NUI2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GPAT2Q6NUI2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPAT2Q6NUI2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPAT2Q6NUI2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms