Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms