Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCAPH2Q6IBW4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms