Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPECC1LQ69YQ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPECC1LQ69YQ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPECC1LQ69YQ0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms