Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG16L1Q676U5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms