Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG9BQ674R7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms