Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LARP1BQ659C4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms