Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CARMIL1Q5VZK9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL1Q5VZK9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms