Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVC0

C1orf146, Uncharacterized protein C1orf146, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf146Q5VVC0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C1orf146Q5VVC0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C1orf146Q5VVC0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf146Q5VVC0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms