Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GFI1BQ5VTD9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GFI1BQ5VTD9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms