Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYDE2Q5VT97 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYDE2Q5VT97 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms