Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC18Q5T9S5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC18Q5T9S5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms