Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP2LQ5T4T6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP2LQ5T4T6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms