Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC122Q5T0U0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC122Q5T0U0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms