Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL5A1-AS1Q5SY13 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL5A1-AS1Q5SY13 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms