Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAP1Q5SW96 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRAP1Q5SW96 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms