Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM240Q5SV17 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM240Q5SV17 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms