Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NUP188Q5SRE5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP188Q5SRE5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms