Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1Q5M775 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPECC1Q5M775 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms