Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFHC1Q5JVL4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFHC1Q5JVL4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFHC1Q5JVL4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms