Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RTL5Q5HYW3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RTL5Q5HYW3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RTL5Q5HYW3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms