Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ODF2Q5BJF6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODF2Q5BJF6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms