Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KHDC3LQ587J8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KHDC3LQ587J8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms