Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms